- Samara - frutto secco indeiscente, dotato di un’ala.
- Scanalato o solcato - fusto con scanalature longitudinali oppure ripiegato a forma di canale.
- Scarpata - superficie molto inclinata di un terreno.
- Scudetto o marza o occhio - gemma staccata dal suo supporto con un frammento di corteccia con lo scopo di usarla per innestare.
- Seme - elemento finale delle fasi della riproduzione sessuata delle piante a fiore. Contiene il germe della futura pianta, uno o due cotiledoni e sostanze di riserva. Il tutto è racchiuso da un doppio tegumento.
- Seghettato - margine delle foglie a denti acuti.
- Semplice - dicesi fusto senza ramificazioni.
- Sempreverde - pianta con foglie persistenti.
- Sepali - parte del fiore che forma il calice.
- Sessile - inserito direttamente sul ramo senza peduncolo: fiore sessile; oppure senza picciolo: foglia sessile.
- Setole - peli vegetali abbastanza rigidi e lunghi, formati generalmente da più cellule sovrapposte.
- Setta - foglia divisa da intagli profondi.
- Siconio - infruttescenza carnosa che porta piccoli semi
- Siliqua - frutto secco che si apre in due valve con setto centrale portante i semi.
- Soro - fruttificazione delle felci.
- Spiga - infiorescenza con fiori senza peduncolo.
- Spinoso - con spine.
- Spogliante - che perde le foglie.
- Spontanea - pianta che cresce senza alcun intervento dell’uomo, quindi né importata né coltivata.
- Specie - gruppo di piante originate da genitori comuni con tratti comuni, più numerosi che in tutte le altre piante, e tali da poter essere denominate con lo stesso nome. Es.: serpillo, specie del genere timo.
- Spora - corpo riproduttivo di una crittogama.
- Sporangio - organo riproduttore di spore.
- Squame o scaglie - foglie modificate, coriacee, raramente verdi, con funzione protettiva rivestimento di rizomi, di bulbi, di gemme ecc.
- Stame - organo maschile del fiore.
- Staminifero - fiore provvisto soltanto di stami, quindi maschile.
- Stelo - peduncolo spoglio che si diparte dal colletto e sorregge uno o più fiori.
- Stepposa - un’area che presenta le caratteristiche vegetali proprie della steppa.
- Stilo - prolungamento verticale dell’ovario, a forma di colonna, sormontato da uno stimma.
- Stimma - regione dell’ovario che raccoglie e trattiene i granuli pollinici.
- Stipite - fusto colonnare formato dai piccioli delle foglie, caratteristico delle palme.
- Stolone - fusto strisciante, aereo o sotterraneo, che emette radici dai nodi e riproduce così la pianta.
- Stolonifera - pianta che produce stoloni, la loro moltiplicazione vegetativa è più rapida di quella per seme. Da una pianta di fragola si ottengono, durante la stagione, anche più di 100 piantine.
- Strisciante - fusto e radice che si distendono sul terreno; emettono ricacci in diverse direzioni.
- Succolenti - piante con tessuti carnosi.
- Suffrutice - pianta i cui fusti annuali lignificano soltanto in parte.